Управление муниципальным бюджетным учреждением дополнительного образования «Центр дополнительного образования детей» осуществляется в соответствии с законодательством Российской Федерации, Уставом учреждения, на основе сочетания принципов демократичности, открытости, единоначалия и самоуправления.
Единоличным исполнительным органом образовательного учреждения является директор, который осуществляет текущее руководство деятельностью учреждения.
Коллегиальным органом управления в учреждении является общее собранием работников МБУДО ЦДОД, которое создается в целях выполнения принципа самоуправления образовательным учреждением, расширения коллегиальных и демократических форм управления.
Вопросами организации, оптимизации и совершенствования образовательной деятельности занимаются педагогический и методический советы.
Управляющий совет, реализующий принцип демократического и государственно-общественного характера управления, занимается стратегическим планированием деятельности учреждения, определением политики для достижения образовательных и воспитательных целей, контролем за содержанием дополнительного образования.
Порядок выборов органов самоуправления учреждения и их компетенция определяется Уставом и соответствующими локальными актами учреждения.
Структурные подразделения, обеспечивающие функционирование учреждения, представлены 4 отделами:

• образовательной деятельности;
• организационно-массовой работы и выставочной деятельности;
• социально-педагогической деятельности;
• проектной деятельности и конкурсного движения.

Деятельность отделов обеспечивает выполнение целевых задач развития учреждения и предполагает изменение содержания, форм и методов работы с детьми и подростками, а также научно-методического сопровождения деятельности педагогического коллектива, поиска новых подходов управления развитием учреждения.